Gastroenteritis bacteriana
Es una inflamación del estómago e intestinos causada por bacterias.
Agente etiológico:
• Campylobacter jejuni (ver: enteritis por Campylobacter).
• E. coli (ver: enteritis por E. coli).
• Salmonela (ver: enteritis por salmonela).
• Shigella (ver: enteritis por Shigella).
• Estafilococo.
• Yersinia.

Gastroenteritis viral
Es la inflamación del estómago y los intestinos a raíz de un virus. La infección puede llevar a que se presente diarrea y vómitos y, algunas veces, se le denomina "gripe estomacal".
Agente etiologioco:
• Astrovirus
• Adenovirus entérico
• Norovirus, también llamado virus similar a Norwalk, que es común entre niños en edad escolar
• Rotavirus, la principal causa de gastroenteritis …ver más…

Escherichia coli enterohemorrágica o verotoxigénica (ECEH)
La convención internacional de nomenclatura de patógenos ha recomendado el uso de STEC (Shiga Toxin Escherichia coli) para este grupo, debido a que estas bacterias producen una toxina citotóxica para células Vero de cultivo de similaridad estructural a la toxina producida por Shigella dysenteriae. Las STEC producen verotoxinas que actúan en el colon. Sus síntomas son: primero colitis hemorrágica, luego síndrome urémico hemolítico (lo anterior más infección del riñón, posible entrada en coma y muerte), y por último, púrpura trombocitopénica trombótica (lo de antes más infección del sistema nervioso central). Esta cepa no fermenta el sorbitol y posee un fago, donde se encuentran codificadas las verotoxinas, también llamadas "Toxinas Shiga", no posee una fimbria formadora de mechones, en vez de esto posee una fimbria polar larga que usa para adherencia.
Escherichia coli enteroagregativa (ECEA)
Sólo encontrada en humanos. Son llamadas enteroagregativas porque tienen fimbrias con las que aglutinan células en los cultivos de tejidos. Se unen a la mucosa intestinal causando diarrea acuosa sin fiebre. No son invasivas. Producen hemolisina y una enterotoxina ST similar a la de las enterotoxigénicas.
Escherichia coli de adherencia difusa (ECAD)
Se adhiere a la totalidad de la superficie de las células epiteliales y habitualmente causa enfermedad en niños inmunológicamente no