El agroecosistema debe ser analizado en su conjunto, observando los elementos que lo configuran (suelo, clima, cultivos, insectos, etc.) y las actuaciones humanas sobre él (fertilización, riego, labores, tratamientos, etc.) globalmente y atendiendo también a las múltiples interrelaciones que se establecen.
Los factores que llegan a considerarse plaga o enfermedad no lo son por sí mismos, son consecuencia de un desequilibrio, ya sea por fallos nuestros, variaciones en el clima o cualquier otro elemento perturbador que ha llevado a esa situación. Por lo tanto, el primer paso a dar cuando surge un problema fitosanitario es analizar las causas que han producido ese desequilibrio e intentar reestablecerlo
Prevención de ataque de insectos y …ver más…

Por el contrario, los biocidas poco selectivos, como la rotenona o las piretrinas, crean resistencias en las plagas que se tratan y eliminan también a los enemigos naturales.
Las formas resistentes dificultan su tratamiento posterior, por lo que su aparición ocasiona numerosos perjuicios. Los daños sobre la fauna útil provocan que las poblaciones controladas por ellos se conviertan en plaga, al eliminar sus enemigos naturales. Para evitar estos problemas debemos eludir al máximo el empleo de sustancias que puedan generarlas y, principalmente, no emplearlas de forma repetitiva.
En muchos casos el problema generado por los tratamientos es abrir huecos en el nicho ecológico, los cuales son rápidamente ocupados por las especies oportunistas y de rápido crecimiento, entre las que se pueden encontrar muchas plagas y enfermedades. Por ejemplo tras desinfecciones del suelo con vapor o con productos químicos es frecuente su colonización por Fusarium Oxysporum, el cual puede refugiarse en profundidad, al ser resistente a las condiciones extremas, sobreviviendo al tratamiento, y puede reinfectar rápidamente la zona desinfectada al encontrar muy poca competencia.
Labores culturales
Las plantas cultivadas según su ciclo vegetativo, en general, son más resistentes a las plagas y enfermedades