VII.- Capítulo 3
Análisis informático de secuencias moleculares
Paniego, Norma; Heinz, Ruth; Fernández, Paula; Lew, Sergio; Hopp, Esteban 1 Introducción La Bioinformática es el área de las ciencias de la computación que aborda la búsqueda de soluciones a los problemas biológicos con herramientas computacionales. Tanto el análisis genómico como sus disciplinas relacionadas pueden ser abordados desde una perspectiva diferente a partir de la enorme disponibilidad de secuencias moleculares acumuladas en las bases de datos internacionales como GenBank [1], EMBL [2], DDBJ [3] y SwissProt [4]. El impacto de los proyectos genómicos durante los últimos 10 años, ha sido por un lado la creciente disponibilidad de secuencias, y por el otro la gran …ver más…

Posteriormente, con la misma orientación abordaremos aspectos relacionados a la búsqueda, el análisis y la interpretación de secuencias biológicas. 2 Bases de datos moleculares Un proyecto típico de análisis genómico genera secuencias nucleotídicas las cuales se hacen públicas enviándolas a las bases de datos internacionales. No sólo lo hacen los proyectos dedicados a la secuenciación a gran escala. También lo hacen los investigadores involucrados en proyectos más específicos de biología molecular, dado que el depósito de la secuencia es una condición frecuentemente exigida por las revistas internacionales que publican estos trabajos. Así, las bases de datos moleculares se alimentan constantemente y contienen una enorme y heterogénea cantidad de datos que incluyen secuencias de ácidos nucleicos, proteínas, estructuras macromoleculares, etc., asociados a recursos informáticos que asisten el acceso, el envío, la actualización, y la extracción de datos. Existen varios cientos de bases de datos accesibles desde la Web, pero la dinámica enunciada no asegura tener el máximo provecho sustentable de las mismas, empezando por mantener una actualización constante. Con este fin, se pueden revisar catálogos como DBCAT [6], o el componente DATABANK de la plataforma SRS (Sequence Retrieval System [7]) de integración de datos del European Molecular Biology Laboratory (EMBL). Otra fuente de actualización exhaustiva la constituye el primer número de cada año de la revista Nucleic Acid