2.2.6. Detección de los SNPs (Single
Nucleotide Polymorphism)
Se consideran la más reciente generación
de marcadores moleculares, basados en la identificación de
la sustitución de un nucleótido por otro,
representando solamente dos alelos simples. Ellos incluyen la
técnica clasica de RFLPs pero no exactamente detectando la
aparición o abolición de un sitio de
restricción. Constituye una ventaja el hecho de que puedan
ser detectados sobre "arrays" de fase sólida sin necesidad
del empleo de
electroforesis en geles (Rafalski, 2002).
El método
más directo para detectarlos es la secuenciación de
segmentos de ADN, previamente
amplificados por PCR, de varios individuos que representen la
diversidad de la población. Se diseñan cebadores para
amplificar fragmentos de ADN de 400-700pb, derivados
fundamentalmente de genes de interés o
de secuencias reportadas en bases de datos
correspondientes a secuencias expresadas (expressed sequence tag,
EST). Los productos
amplificados se secuencian en ambas direcciones y sus secuencias
se comparan en busca de polimorfismos (Cornide et al.,
2002)
La mayoría de los métodos de
detección de SNPs se basan en la amplificación
usando "multiplex"de una secuencia diana y la hibridación
con oligonuclótidos anclados al "array", cada uno de los
cuales está terminado en un nucleotido polimórfico.
Un paso sencillo de extensión del primer se lleva a cabo
sobre el "array", usando una mezcla de cuatro dideoxinucleotidos
marcados con fluorescencia. Las marcas se
adicionan a los cebadores que se unen perfectamente al ADN, no
siendo así con aquellos que no lo hacen en el extremo
3´. La lectura de
la presencia o ausencia de flourescencia en el "array" permite
obtener el tipo de cada SNP sobre el "array".
Cualquiera de los cuatro nucleotidos puede estar
presente en cualquier posición en el genoma, por lo tanto
se debe suponer que cada SNP tendría cuatro alelos.
Teóricamente esto es posible, pero en la práctica
la mayoría de los SNP tienen solamente dos variantes, la
secuencia original y la versión mutada. Esto se debe a la
vía en que estos aparecen y se distribuyen en una
población. Un SNP se origina cuando una mutación
puntual ocurre en el genoma, convirtiendo un nucleotido en otro.
Si la mutación ocurre en las células
reproductivas de un individuo,
pudiendo ser heredada por uno más descendientes y
después de muchas generaciones, el SNP puede establecerse
en la población. Para que se produzca un tercer alelo, una
nueva mutación debe ocurrir en la misma posición en
el genoma de otro individuo, y este individuo y su descendencia
deben reproducirse de forma tal que el nuevo alelo quede
establecido. Esto no es imposible, pero es poco probable, por lo
tanto la mayoria de los SNP son bialelicos.
Los SNP pueden aparecer tanto en regiones fuera de los
genes (que no afecten la producción o función de
alguna proteína) como en un gen específico, donde
pueden ubicarse en regiones codificantes (relacionados con
cambios en la cantidad de proteína producidas) o no
codificantes (que afectan solo la secuencia de
aminoácidos.
Estos han sido empleados como marcadores para el
diagnóstico de rasgos específicos
(Jordan y Humphries, 1994) por ser abundantes en el genoma bovino
(Heaton et al., 2002), genéticamente estables
(Markovstka et al., 2000) y de análisis fácilmente automatizable
(Lindblan-Toh, 2000), lo que ha permitido además, su
utilización como marcadores para la identificación
animal y pruebas de
paternidad en ganado bovino (Heaton et al., 2002).
Precisamente la necesidad de la automatización, sin la cual sería
muy engorrosa la aplicación de esta metodología, por una parte simplifica el
análisis, pero en nuestras condiciones lo
encarece.
3.
Criterios para seleccionar el tipo de
técnica.
La selección
de la técnica depende del objetivo
trazado. Las técnicas
moleculares brindan información a diferentes niveles
taxonómicos. Todas tienen sus limitaciones y su
aplicación estará determinada en gran medida, por
la información que estamos buscando con la
utilización de un sistema de
marcadores
moleculares, así como la disponibilidad de recursos
necesarios para el desarrollo de
este tipo de técnicas. Entre los factores más
importantes a considerar se encuentran el contenido de
información y el radio
múltipleque cada técnica puede brindar. El
contenido de información refleja el número de
alelos que pueden ser detectados por el marcador en un
número e individuos. El radio múltiple lo
constituyen el número de marcadores que pueden ser
generados por una reacción simple (Breyne et al.,
1997).
La selección del método depende de la
aplicación específica que se desea. Si el objetivo
es identificar el genoma o evaluar la diversidad genética,
los métodos con radio múltiple de elevado o alto
volumen (ej.
AFLP), son apropiados debido a que pueden ser detectados muchos
loci distribuidos al azar po el genoma. Este tipo de marcadores
también son muy útiles en análisis
genotípicos y taxonómicos para construir mapas
genéticos y para identificar marcadores unidos a un
caracter en particular. Para varios aspectos de la biología poblacional
(análisis de paternidad, flujo de genes, etc.) y
mejoramiento genético, los métodos con alto
contenido de información son más útiles
(Cornide et al., 2000).
4. Algunas aplicaciones de los marcadores
moleculares en ganadería
El incremento demográfico, el aumento de los
ingresos y la
urbanización muestran actualmente un notable crecimiento
de la demanda de
alimentos de
origen animal en los países en desarrollo: la "revolución
ganadera". En el pasado estos países hicieron frente a los
aumentos de la demanda principalmente ampliando sus poblaciones
de ganado. Sin embargo, la reducción de la superficie de
tierras disponible para la población agrícola los
obliga ahora a intensificar su producción ganadera, y los
animales
monogástricos, cerdos y sobre todo aves de
corral, constituyen hoy la fuente más importante de
crecimiento del sector ganadero. La importancia de las enfermedades animales como
principal obstáculo para el aumento de la productividad de
la ganadería
crecerá considerablemente, al intensificarse la
producción animal y a crecer la densidad pecuaria
en zonas ecológicas más cálidas y
húmedas. La aplicación de la biotecnología del ADN a la salud animal, mediante
vacunas
más eficaces, baratas y resistentes combinadas con mejores
instrumentos de diagnóstico, podría contribuir en
medida importante a mejorar el control de las
enfermedades, estimulando así la producción
nacional de alimentos y la participación en el comercio
ganadero. La biotecnología ofrece también
considerables posibilidades de mejorar la elaboración de
productos agroindustriales, sobre todo mediante procesos
inocuos para el medio ambiente
y de elevado rendimiento energético. Aunque probablemente
la mayor parte de estas tecnologías no estarán al
alcance de la producción pecuaria tradicional,
resultarán considerablemente accesibles para el sector
comercial e industrial emergente de muchos países en
desarrollo (FAO, 2000).
La biotecnología se está utilizando en
diversos campos de la producción y sanidad animal. Entre
sus principales aplicaciones en ganadería se encuentran la
identificación y chequeo de parentesco, la
contrucción de mapas genéticos, el desarrollo de
nuevos tratamientos de enfermedades. Los marcadores moleculares
constituyen hoy una herramient moderna y poderosa para el viejo
arte de la
selección (Cornide et al., 2000). Entre sus
aplicaciones más inmediatas se encuentran la
identificación de parentesco o de identidad y la
caracterización de la diversidad
genética.
En países de alto desarrollo ganadero y
especialmente en especies de interés económico,
específicamente en vacunos y equinos, la
identificación genética y el obligado
establecimiento de pruebas de paternidad, queda lejos de
cualquier duda como argumento para la fiabilidad y credibilidad
de los libros
genealógicos en las distintas razas (Zaragoza et
al, 1994). En esos países, todo aquel que se dedique
directa o indirectamente a la selección ganadera, debe
aceptar el análisis de conformidad. En vacunos, cerdos y
caballos principalmente, el control de parentesco se ha realizado
de forma rutinaria en la mayoría de los países
mediante la metodología de grupos
sanguíneos y polimorfismos bioquímicos, dirigida su
estandarización por la Sociedad
Internacional de Genética Animal (ISAG). En Europa, desde
hace más de una década, la legislación
acerca del tema exige la obligatoriedad de acompañar todos
los registros e
intercambios de material genético vivo, semen o embriones,
con documentos que
acrediten la veracidad y contrastación de paternidad del
mencionado material genético. Estos métodos
clásicos de polimorfismos bioquímicos y grupos
sanguíneos presentan limitaciones, debido a que estos
representan del 5 al 10% del genoma, no se detectan mutaciones
silenciosas, se requieren técnicas específicas para
cada marcador y la exclusión de paternidad solo suele
llegar al 95% si el número de marcadores es elevado
(Ferreira y Grattapaglia, 1995).
La ISAG, en la XXIII Conferencia
Internacional sobre Genética Animal, decidió el
estudio y estandarización de las técnicas de
análisis de ADN para su posible uso futuro en las pruebas
de paternidad (http://www.inmgen.com), sobre todo de
microsatélites, debido a las características que
los han convertido en marcadores de elección para este
tipo de estudios (Craighead et al., 1995; Schnabel et
al., 2000).
Estos marcadores constituyen una herramienta fundamental
en la construcción de mapas genéticos
(Todd, 1992). Dichos mapas, además de su indudable
interés científico, son herramientas
fundamentales para la identificación y aislamiento tanto
de genes responsables de enfermedades como otros de
interés económico (ej. QTLs)(Rodríguez-Zas
et al., 2002) para posteriormente utilizar esta
información en programas de
mejoramiento animal a través de la llamada
Selección Asistida por Marcadores (Marker Assisted
Selection, MAS). Grisat et al., (2002) y Brunner et
al., (2003) entre otros, han desarrollado metodologías
para la identificación de QTL en bovinos. En esta
última línea de aplicación utilizando
marcadores ligados a genes mejoradores, se puede aumentar la
eficiencia de
la selección en la medida en que estos se introduzcan en
los programas de selección. Esto a su vez facilita el
aislamiento de genes o grupos de genes para la obtención
de animales transgénicos.
El esfuerzo realizado a nivel mundial para la
construcción de los mapas genéticos de distintas
especies está dando sus frutos en la actualidad,
ofreciendo hoy verdaderas aplicaciones prácticas, tanto en
el campo de la salud como en el productivo e
industrial.
En la especie humana (Weissenbach et al., 1992) y
en el ratón (Dietrich et al., 1992), se utilizaron
secuencias anónimas de microsatélites para la
construcción de mapas con una distancia media entre
marcadores consecutivos de 5cM. En ratas, se publicó un
mapa compuesto exclusivamente por microsatélites asociados
a secuencias codificantes (Serikawa et al., 1992). En la
especie bovina, se estimó que se necesitaría un
mínimo de 150-200 marcadores para construir un mapa de 20
cM de resolución (Lange y Boehnke, 1982; Steele y Georges,
1991).
En la actualidad se ha pasado de la asignación de
los genes con herencia
mendeliana a grupos de ligamiento, mediante cruces de estirpes de
ratones con fenotipos mutantes, a las nuevas
tecnologías como el "clonaje posicional" o
"genética inversa", en el que una vez encontrado un
marcador asociado a una enfermedad, se busca el gen responsable
de ella (Takeda et al.,2002), y al "clonaje funcional",
basado en el
conocimiento previo de la base bioquímica
de la proteína o enzima causante, por ejemplo, de una
enfermedad, para posteriormente localizar el gen (Collins, 1992;
Permyakov et al., 2001). De esta forma, en la especie
humana se han encontrado los genes responsables de la anemia
falciforme (Saiki et al., 1985), la distrofia muscular de
Duchenne (Chamberlain et al., 1988), y la fibrosis
quística (Estivill et al., 1989), entre
otros.
A pesar de que este campo no se encuentra tan
desarrollado en las especies productivas, este tipo de
metodología también se ha utilizado. Un ejemplo es
la detección del gen responsable de la acondroplasia en
bovinos (Takeda et al., 2002). Una vez conocido, se ha
realizado un test mediante PCR
que permite identificar la enfermedad en cualquier muestra que
contenga ADN. Otro ejemplo lo representa el conocido
síndrome BLAD (Bovine Leucocite Adhesion Deficience) o
"LAD bovine" (Kehrli et al., 1992) que ha sido propagado
por la utilización del semen de un semental canadiense
portador de la enfermedad. Esta se debe a un defecto de la
expresión de la proteína CD18 causado por una
mutación en el gen que origina una alteración en el
transporte de
los leucocitos desde la sangre a los
lugares de infección (Smith et al., 1989; Shuster
et al., 1992). El método de diagnóstico
desarrollado por Kehrli et al., (1992a), consiste en la
amplificación específica de un fragmento del gen
CD18 mediante la técnica de PCR (Tammen et al.,
1996; Zsolnai y Fesüs, 1996; Mukhopadyaya et al.,
2000).
En el campo de la sanidad animal se han utilizado estas
metodologías moleculares en el desarrollo de nuevos
tratamientos de enfermedades, en la creación de vacunas
como la de la fiebre aftosa,
primer producto de la
biología molecular, la de la tuberculosis
bovina (Buddle, 1996) o de la brucelosis bovina (Al-mariri et
al., 2002), así como en la creación de
anticuerpos monoclonales (utilizados en vacunas y tratamientos),
inmunoglobulinas, etc. Pero no solo se han aplicado en lo
relacionado con la salud veterinaria,
sino también en lo referente a los aspectos que influyen
en la producción y calidad de la
leche, sobre
todo en el ganado bovino.
De los resultados obtenidos investigaciones
realizadas en ganado bovino autóctono cubano para
determinar la estructura
genética de los loci de las proteínas
lácteas y de los microsatélites se han identificado
tres elementos fundamentales en los que se puede resumir la
importancia de ese trabajo (Uffo,
2003):
En primer lugar, se identificó un grupo de
alelos que pueden ser utilizados como marcadores raciales de las
poblaciones estudiadas, tanto para las proteínas
lácteas como para 30 loci microsatélites
recomendados por FAO-ISAG para estudios de biodiversidad,
que no han sido descritos en la literatura consultada,
distribuidos en las tres razas cubanas, permitirá contar
con un perfil alélico específico para cada
raza.
Estos resultados son de gran utilidad para los
genetistas y los criadores de ganado bovino. El hecho de que en
cada una de las razas cubanas existan alelos "únicos", es
un elemento importante para la realización de estudios de
caracterización racial, que permitirán
discriminaciones entre individuos de una raza u otra. Aquí
los genetistas tiene una herramienta para la planificación de los cruzamientos entre
razas, el diseño
de nuevos cruzamientos y la evaluación
de la selección genética, por la
identificación de alelos característicos de Bos
indicus, que pueden estar asociados con
características de resistencia.
En segundo lugar, se tiene la gran diversidad
genética en tres poblaciones cubanas analizadas, de suma
importancia para la ganadería cubana. El Criollo de
Cuba, ganado
autóctono cubano, descendiente de los primeros bovinos
introducidos en el país en épocas de la
colonización, en cuyo genofondo hay valiosa
información acerca de los procesos de adaptación al
ambiente
tropical y de producción en condiciones
difíciles.
En cambio el
Cebú cubano, es la base genética que ha aportado la
resistencia a las nuevas razas cubanas que contienen sus genes y
que se sigue usando como genotipo de resistencia al ambiente
tropical. Por su parte, el Siboney de Cuba es una raza
sintética en la cual se combinan las
características productivas del ganado Holstein y las de
rusticidad del Cebú.
Los valores de los
indicadores
utilizados para la caracterización poblacional evidencian
una elevada variabilidad en cada una de las razas cubanas
estudiadas, lo que permite a los genetistas manejar adecuadamente
esta información para ser utilizada al trazar estrategias de
cruzamientos y programas de mejora genética, así
como en el mantenimiento
y conservación de la diversidad
genética.
Como tercer elemento de interés,
está la confirmación de la estrecha relación
del Criollo de Cuba con algunas razas españolas. La menor
distancia genética encontrada entre el Siboney y el
Criollo es una evidencia de que comparten genes de la misma
especie (Bos taurus) aunque provenientes de razas
diferentes. Esto constituye una información útil si
se trata de investigar las relaciones de nuestro ganado con sus
ancestros, sobre todo del ganado Criollo. En este caso, la
confirmación de la cercanía filogenética con
las razas Asturianas y Morenas permite corroborar las rutas de
migración de los colonizadores hacia
América, pues dichas razas están
ubicadas geográficamente en zonas donde entonces se
encontraban los principales puertos de navegación de la
península. Nuestros resultados contribuyen también
a corroborar la composición genética de las razas
españolas que se utilizaron como material de referencia
(Martin-Burriel et al., 1999). Este análisis
filogenético ofrece también la posibilidad de la
realización de estudios de la biodiversidad del ganado
bovino cubano, al permitir la comparación de sus
genofondos propios con otros de la región y de
Europa.
Además de estos tres elementos fundamentales, la
utilización de las técnicas moleculares en la
ganadería cubana tiene otras posibilidades de
aplicaciones. Tanto las proteínas lácteas como los
microsatélites, se están haciendo cada vez
más imprescindibles en la caracterización de
animales valiosos ya sea por su desempeño productivo o porque se presuma
que contengan en su genoma combinaciones de genes
difíciles de reproducir en un futuro. Una
aplicación actual muy importante en nuestra
ganadería es la selección de individuos para el
programa de
fertilización in vitro y clonación bovinas.
Por estos métodos moleculares es posible hoy en
Cuba, identificar los genotipos que portan los animales
preseleccionados por sus características productivas y
recomendar que sean seleccionados finalmente o rechazados por su
valor
genético. También, conociendo los patrones
alélicos de los individuos que se seleccionen, es posible
realizar una comparación individual (identificación
de individuos) una vez que se obtenga la descendencia clonada,
incluso en edades tan tempranas del desarrollo como en el
embrión. De hecho, algunos de los animales incluidos en
esta investigación pertenecen al grupo de las
madres de sementales de la raza Siboney que han sido
preseleccionas para ser donantes de células para la
clonación y/o fertilización in vitro.
Este es un elemento que contribuye en gran medida a incrementar
la eficiencia en la selección de los individuos y a la
utilización de la amplia gama de recursos necesarios para
estas investigaciones.
Otra de las aplicaciones inmediatas que tiene la
utilización de estos marcadores, es la
determinación de paternidad en ganado bovino con una
probabilidad
de exclusión del 99% (Osta, 1993). Estos métodos
son relativamente costosos si se comparan con los tradicionales
de grupos sanguíneos, pero están plenamente
justificados si se trata de animales valiosos. En esta
categoría de animales valiosos se pueden incluir las
donantes de células para la clonación o los
sementales para la fertilización in vitro, de los
cuales, en algunos casos, ya se cuenta con sus genotipos, por lo
que se pueden utilizar como referencia e incluso, como controles
positivos.
También es posible la introducción a mediano plazo, de la
selección asistida por marcadores para la
producción de leche en los programas de mejora, dado que
en las tres razas se identificaron alelos que se describen con
efectos que favorecen una mejor composición de la leche.
Este aspecto es importante pues, si bien es cierto que el
país está necesitado de incrementar la
producción de leche, esta debe ser una leche con adecuada
calidad.
La determinación de los genotipos de las
proteínas lácteas contribuirá también
a reducir los intervalos entre generaciones al brindar la
posibilidad de selección en edades muy tempranas de
desarrollo y en ambos sexos. Los costos se pueden
reducir utilizando eficientemente los recursos e insumos de que
dispone nuestra ganadería para el mantenimiento de los
animales que potencialmente pueden ser mejores para la
producción de leche, mediante la integración del comportamiento
reproductivo, sanitario y de manejo.
5.
Glosario
ADN Acido desoxirribonucleico, es la fuente de
información genética para todas las actividades
celulares durante toda la vida de la célula
o del organismo. Es una molécula formada por una doble
hélice de dos cadenas complementarias de polímeros
de bases nitrogenadas que se han denominado: adenina (A), timina
(T), citosina (C) y guanina (G) y que se unen a un esqueleto de
azúcares y fosfatos, siendo el material constituyente de
los genes en los cromosomas.
Alelo Una de las dos alternativas en que puede
manifestarse un gen en un cromosoma. Forma particular de un gen
de un locus específico.
Oligonucleotido alelo-específico (ASO)
Oligonucleotido sintético, a menudo de alrededor de 20
bases de longitude, el cual hibrida con una secuencia blanco
específica y cuya hibridación puede verse afectada
por werrores de acoplamiento bajo condiciones cuidadosamente
controladas. A menudo están marcados y se usan como sondas
para hibridación específica.
Annealing Asociación de cadenas
complementarias de AND o ARN para formar una doble
hélice.
ANTICUERPO MONOCLONAL Anticuerpos
estructuralmente idénticos que reconocen únicamente
un tipo de antígeno.
ANTICUERPO Proteína de gran especificidad
producida por el sistema inmune en respuesta a una
inmunización o invasión del cuerpo por algún
microorganismo. Estas proteínas reciben el
nombre de inmunoglobulinas.
ARN Acido ribonucleico. Permite la
transmisión de información genética
codificada en el ADN, especificando el orden de los
aminoácidos en una proteína.
Biotecnología Utilización de
organismos vivos en procesos industrials.
CEBADOR (ver oligonucleotido). Oligonucleotido
que se utiliza para iniciar la reacción de PCR. Su
especificidad depende de la homología de su secuencia con
la región flanqueante de aquella que se quiere
amplificar.
Código Genético Su fuente de
información es la secuencia de bases.
Cromosomas Formados por una molécula de
ADN, asociados a proteínas pequeñas. Se localizan
en el núcleo de la célula.
CHIPS DE DNA. Dispositivo miniaturizado, del
tamaño de un portaobjetos de microscopio, que
contiene impresos miles de fragmentos de DNA. Estos fragmentos
pueden llegar a representar el genoma completo.
Desnaturalización Disociación de
las cadenas complementarias para dar cadenas simples de AND o
ARN.
DNA fingerprinting Método que produce un
patrón de bandas de hibridación (huella
genética) en Southern blot que pueden usarse para
laidentificación individual
DNA MICROSATÉLITE Secuencias (fragmentos)
de ADN de pequeña longitud que se encuentran muy repetidas
en determinadas regiones del genoma de las células
eucariotas y cuya función es por el momento desconocida.
Las variaciones que se observan en el número de
repeticiones sirven para diferenciar a dos individuos de la misma
especie.
Dominancia Efectos genéticos debidos a
interacciones entre aelos dentro de un locus. Por ejemplo, cuando
hay dominancia completa, los genotipos que contienen una o dos
copias del alelo dominante tienen el mismo fenotipo.
ENZIMAS Un grupo de proteínas que realizan
una determinada función con actividad catalítica
que favorece la reacción de dos moléculas o
compuestos para dar lugar a una tercera molécula
diferente.
Expressed sequence tag (EST) Secuencia corta de
cDNA parcial (generalmente de 100300 bp)
Gametos Células reproductivas,
óvulos y espermatozoides
Gen Es una secuencia de bases de ADN que contiene
la información para sintetizar una cadena
polipeptídica específica o un polímero de
aminoácidos que conforman una proteína. Unidad
fundamental física y funcional de
información genética o de la herencia. Se localizan
linealmente en los cromosomas y se calcula que en los genomas de
animales superiores existen de 50 000 a 100 000 genes
funcionales.
Genoma Todo el material genético presente
en una célula de un organismo.
Genotipo Conjunto de genes contenido en cada uno
de los núcleos de las células de un
individuo.
Heterocigótico Se origina por la
unión de gametos que difieren respecto a la clase,
cantidad o disposición de sus genes. Se usa generalmente
respecto a diferencias génicas particulares.
Homocigótico Derivado de la unión
de gametos idénticos respecto a la clase, cantidad y
disposición de sus genes o de parte de ellos.
INMUNOGLOBULINA (ver anticuerpo).
Proteínas producidas por los linfocitos B del sistema
inmune. También llamadas anticuerpos.
Loci Plural de locus.
Locus Posición ocupada por un gen
en un cromosoma en relación con su orden
lineal.
Marcadores Puntos de referencia en los cromosomas
que evidencian rasgos de variabilidad genética. Son
cualquier fenotipo molecular oriundo de un gen específico.
Son secuencias de ADN o de proteínas polimírficas
derivadas de una
ubicación cromosómica simple. Si cumplen con las
leyes
básicas de la herencia de Mendel son
Marcadores Genéticos.
MOLÉCULA Compuesto químico formado
por la reacción de varios elementos
químicos.
Mutaciones Fuente de variabilidad genética
de la población. Pueden o no generar cambios en la
secuencia de proteínas que codifican los genes y por
supuesto afectar o no las funciones de los
organismos.
NUCLEÓTIDO Son las unidades básicas
del DNA. Hay 4 nucleótidos: adenosina (A), guanosina (G),
citosina (C) y timidita (T). Cada uno de ellos esta constituido
por una molécula de desoxirribosa a la que se une un grupo
fosfato y una base nitrogenada.
OLIGONUCLEÓTIDO (ver también
cebadores). Una cadena corta de nucleótidos. Se suelen
obtener por síntesis
química.
Punto de mutación Mutación
originada por una pequeña alteración en la
secuencia de ADN en un locus
POLIMERASA (DNA polimerasa). Enzima responsable
de la síntesis del DNA por "polimerización" de
nucleotidos en cadenas de tamaño variable.
Polymorfismo (1) Estrictamente, la existencia de
dos o más variants (alelos, fenotipos, variants de
secuencias, variants de estructuras
cromosómicas) en una frecuencia de aparición
significativa en una población. (2) Cualquier variante de
secuencia presente en una población con una frecuencia
>1%, (3) cualquier variante de secuencia no patogénica,
independientemente de su frecuencia de aparición. Puede
estar originado por una mutación en un gen, donde la nueva
forma del gen o alelo se hereda en la misma manera que el gen
original.
Primer (cebador) oligonuclotido corto, de a
menudo 15-25 bases de longitude, los cuales se unen
específicamente a una secuencia blanco para permitir que
una polimerasainicie la síntesis de una cadena
complementaria.
Sonda Fragmento de ADN o ARN conocido (o una
colección de diferentes fragmentos conocidos) los cuales
se usan en los ensayos de
hibridación para identificar secuencias de ADN o ARN muy
relacionadas (molécula "blanco" o "diana")
Proteínas Productos de los
genes.
QTL Loci de efecto cuantitativo, son genes
con efectos mayores en características afectadas por
muchos loci con efectos generalmente pequeños (poligenes),
importantes en la determinación de caracteres
continuos
ADN repetitivo Secuencia de ADN que se presenta
en muchas copias idénticas o similares en el genoma. Las
copias pueden estar repetidas en grupos (tandem) o dispersas por
el genoma.
Estructura secundaria Regiones de ácidos
nucleicos de cadena simple o moléculas de proteínas
o polipéptidos donde ocurren enlaces
químicos entre nucleotidos
SNP (single nucleotide polymorphism) Cualquier
variación de un nucleotido simple. SNPs incluyen RFLPs y
otros polimorfismos que no alteren ningún sitio de
restricción. Aunque menos informativos que los
microsatélites, los SNP son mas factibles para monitoreos
automatizados y a grandes
SSCP o SSCA Polimorfismo o análisis de
conformación de cadena simple, método
comúnmente utilizado para elmonitoreo de mutaciones
puntuales.
TERMOCICLADOR Instrumento computerizado que
permite calentar o enfriar de forma controlada una mezcla de
sustancias reactivas. Con este instrumento se lleva a cabo la
producción de múltiples copias
(amplificación) del ADN mediante la reacción de la
polimerasa en cadena (PCR), por lo que a los termocicladores se
les denomina coloquialmente PCRs.
Transcripción La información
genética contenida en el ADN es copiada al ARN mensajero
(ARNm).
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Datos del autor:
Odalys Uffo Reinosa.
Fecha de nacimiento: 18 de julio de 1969
Categoría Científica: Investigador
Auxiliar
Grado Científico: Doctor en Ciencias
Veterinarias
Licenciada en Radioquímica, graduada en el
Instituto de Ciencias y Tecnología Nucleares
de Cuba en el año 1992. Comenzó a trabajar en el
Centro Nacional de Sanidad Agropecuaria (CENSA) y actualmente
cuenta con 14 años de experiencia profesional. Es
investigador auxiliar y se graduó de Doctor en Ciencias
Veterinarias en Diciembre de 2003.
Algunos de las temáticas de
investigación que ha trabajado
- Proyecto para la obtención y
purificación de aprotinina y su posible medición en sangre. - Proyecto para el aislamiento y cuantificación
de fosfatasa alcalina a partir de intestino de
ternero. - Iodación de testosterona y desarrollo de
purificación de la misma para su uso en RIA. - Desarrollo de un ensayo
inmunoenzimático de testosterona por ELISA. - Preparación de inmunógenos de
progesterona y su utilización en la obtención de
anticuerpos en conejos y carneros. - Síntesis de conjugados de T3 y T4.
- Desarrollo de una metodología para el
diagnóstico de aflatoxina B1 en orina por un
método cromatográfico. - Detección de proteínas por
electroforesis en SDS-PAGE. - Purificación de una proteína
recombinante de Anaplasma marginale. - Polimorfismo genético por marcadores
moleculares en bovinos, equino y caninos. - Biodiversidad de ganado bovino.
Actualmente es la J´ Laboratorio de
Polimorfismo Genético y pertenece al Grupo de Lactación de la Dirección de Salud y Producción
Animal
Esta revisión que se remite para su
evaluación fue realizada como parte de su tesis doctoral y
actualizada en mayo de 2006.
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