Definiciones de Bioinformática
? La Bioinformática obtiene conocimiento a partir del análisis informático de los datos biológicos. La investigación en bioinformática incluye el desarrollo de metodologías para el almacenamiento, recuperación y análisis de los datos. (Institute Pasteur, France)?
? Bioinformática es la investigación, desarrollo o aplicación de herramientas informáticas para obtener, almacenar, organizar, archivar, analizar o visualizar datos biológicos. (National Institutes of Health, USA)?
? La Bioinformática es una integración de métodos matemáticos, estadísticos e informáticos para analizar datos biológicos, bioquímicos y biofísicos. (Georgia Institute of Technology, USA)?
? La Bioinformática es la ciencia y la tecnología para obtener, administrar y procesar la información biológica. (Missouri University, USA)?
Campos activos en Bioinformática
? creación, mantenimiento y explotación de bases de datos
? anotación de secuencias genómicas
? anotación funcional de genes
? predicción de estructura secundaria de proteínas
? análisis evolutivos
? análisis de expresión génica (microarrays)?
Campos activos en Bioinformática
? creación, mantenimiento y explotación de bases de datos
Campos activos en Bioinformática
? anotación de secuencias genómicas
Campos activos en Bioinformática
? anotación funcional de genes
Campos activos en Bioinformática
? predicción de estructura secundaria de proteínas
Campos activos en Bioinformática
? análisis evolutivos
Campos activos en Bioinformática
? análisis de expresión génica (microarrays)?
Campos activos en Bioinformática
? creación, mantenimiento y explotación de bases de datos
? anotación de secuencias genómicas
? anotación funcional de genes
? predicción de estructura secundaria de proteínas
? análisis evolutivos
? análisis de expresión génica (microarrays)?
Conceptos horizontales en Bioinformática
? Open Source (licencia GNU)?
? Lenguajes de programación (Perl, R, Java…)?
? Algoritmos (BLAST, Fasta,…)?
? Linux
? Bases de datos relacionales (SQL, XML)?
? Arquitectura cliente–servidor (web-services)?
? Clusters de PCs
Conceptos horizontales en Bioinformática
? Open Source (licencia GNU)?
? Lenguajes de programación (Perl, R, Java…)?
? Algoritmos (BLAST, Fasta,…)?
? Linux
? Bases de datos relacionales (SQL, XML)?
? Arquitectura cliente-servidor (web-services)?
? Clusters de PCs
Movimiento Open Source
Distribución libre del código fuente de los programas.
Posibilidad de modificación y redistribución del software y su código fuente.
– mayor número de programadores implicados
– mayor número de usuarios poniendo a prueba el software
– mayor tasa de mejora, adaptación y solución de errores en el código (bugs)?
– creación de un software no opaco para el usuario
http://www.opensource.org
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