Hidrografía
Está conformado por cuatro islas principales de norte a sur: Hokkaido, Honshu, Shikoku y Kyushu y muchas otras islas más pequeñas, extendiéndose en su totalidad unos 2400 km. Ríos:

Si algo caracteriza a Japón, además de sus montañas, es la abundancia en ríos y lagos.
Los ríos de Japón suelen ser rápidos, abruptos y rectilíneos No obstante, los ríos japoneses son caudalosos y regulares, gracias a un clima propicio a las precipitaciones la mayor parte del año.
Se despeñan desde las alturas de las cordilleras meso insulares siguiendo, en general, las líneas de falla que presentan los volcanes y se forman principalmente por aguas del deshielo. Aunque Japón tiene abundantes cursos de agua, no hay grandes ríos …ver más…

Existen dos canales adicionales que desembocan en el mar, el río Shinshinano y el canal Sekiya.
Otros ríos destacables son el Tone, de 322 km de longitud. , y que riega la llanura de Kanto; Kitakami, y Mogami. en la isla de Shikoku, el más largo es el Yoshino. La cuenca del río Yoshino es la más extensa de la isla de Shikoku y la única que se extiende por las cuatro prefecturas que conforman la isla.
Y por ultimo en la isla de Kyūshū, el rio principal es el Chikugo, con una longitud total de 143 kilómetros (89 millas), fluye desde el Monte Aso a través de Kumamoto, Oita, Fukuoka y Saga prefecturas de Japón y desemboca en el mar de Ariake.
Lagos:
Los lagos más grandes se encuentran en las islas de Honshu y Hokkaido. la mayoría de los lagos son de montaña y tienen un origen tectovolcánico. Se alojan en el interior de los cráteres, detrás de los cordones de lava y en depresiones rodeadas de verdes colinas.
En la isla de Hokaido destacan los lagos Saroma, de 151 km², Kussharo, de 80 km² y Shikotsu.
El lago mas grande de japon es el Lago de Biwa, con una superficie total de 685 kilómetros cuadrados se encuentra al noreste de Kyoto en la isla de Honshu.
Otros lagos importantes de esta isla son el Kasumi-ga, de 168 km², el lago Inawashiro, de 103 km², el lago Hamana, el lago Towada y el lago