ESCUELA POLITÉCNICA DEL EJÉRCITO

DEPARTAMENTO DE CIENCIAS DE LA VIDA
Ingeniería en Biotecnología

BIOINFORMÁTICA
Tema:
ALINEAMIENTO GLOBAL DE SECUENCIAS MEDIANTE LA APLICACIÓN DEL ALGORÍTMO DE
“Needleman y Wunsch”
Integrantes:
Andrade Rosa Elena
Gordillo Richard Paul
Noblecilla Yusell
Peralta Gabriela
Suarez Daysi
Velásquez Verónica
Carranza Daniel
Lascano Alejandro

Curso:
Séptimo Nivel - Paralelo “A”

DEDICATORIA

Este trabajo se lo dedicamos a todas las personas que estuvieron dándonos su apoyo mientras los realizamos y principalmente a Dios que nos ha dado la capacidad suficiente para culminarlo de la mejor manera.

AGRADECIMIENTO

El presente trabajo pudo ser realizado gracias a la cooperación en conjunto …ver más…

MARCO TEORICO

La identidad de secuencias, similitud y homología es aplicada en la comparación de dos secuencias (Chothia,1986)
El algoritmo Needleman-Wunsch realiza un alineamiento global de dos secuencias. Es comúnmente usado en bioinformática para alinear secuencias de nucleótidos o proteínas. Fue propuesto en 1970 por Saul Needleman y Christian Wunsch .El algoritmo Needleman–Wunsch es un ejemplo de programación dinámica, y está garantizado que encuentre el alineamiento con el puntaje máximo (Holm, 2007)
Al alinear dos secuencias de nucleótidos lo que buscamos es descubrir cuales son los caracteres equivalentes. En Biología, esta equivalencia tiene un correlato evolutivo; Una zona de DNA que es duplicada, comenzara a acumular cambios en su secuencia por medio de mutaciones puntuales y eventualmente podrá recibir fragmentos completos de DNA de otras fuentes (Alexandrov y cols,1992).

Dependiendo de la cantidad de tiempo transcurrido desde el momento de la duplicación, el número de bases nucleotídicas inalteradas disminuirá, y el largo total de las secuencias cambiará, haciendo difícil establecer las equivalencias correctas entre ellas (Gibrat,1996). De este modo, es razonable esperar tres tipos de equivalencias entre los caracteres de dos secuencias al hacer un